Okul olarak ilk bina 1849-1854 tarihleri arasında yapılmış olup Çukur Medrese ve Murat Paşa Camiinde okuyan öğrencilere ilk talebe yurdu olarak hizmet vermiştir.

Daha sonra 1890 yılında kız ortaokulu olmuştur. 1904 yılında ise 5 sınıfı ilkokula dönüşmüştür. Cumhuriyetten sonra 1937 yılında 23 Nisan ilkokulu adını almış,

1974 yılında okul binasının yenilenmesine karar verilmiştir. Hava Kuvvetleri Personeli Yardımlaşma Derneğinin katkılarından dolayı, 8 derslikli olarak yapılan ve 25 ekim 1975 yılında hizmete açılan

okulun adı, 23 Nisan Hvacılar İlkokulu olarak değiştiilmiştir. 2000-2001 Eğitim-Öğretim yılından 2005-2006 öğretim yılına kadar okul Niğde İmam-Hatip Lisesi binasında hizmet vermiştir.

2005-2006 yılından itibaren Dere Mahallesinde bulunan yeni binasında hizmet vermektedir.

Okulumuz 2018 yılında Ortaokul ve İlkokulun ayrılması sonucu Necip Fazıl Kısakürek İlkokulu ismini almıştır. Halen 24 İlkokul sınıfı 5 Okul öncesi sınıfı ile Eğitim -Öğretime devam etmektedir.